Αν και η σωρός του δεν έχει βρεθεί και σίγουρα αποτελεί την επιτομή της αρχαιολογικής έρευνας, έχουν γραφτεί πολλά για τους τυχόν λόγους που τον οδήγησαν στο θάνατο.
Ωστόσο, μια νέα θεωρία εξηγεί την αιτία του θανάτου του και μάλιστα η επικεφαλής ερευνήτρια ζητά να ξαναγραφτεί η ιστορία της ζωής του από την αρχή.
Συγκεκριμένα όπως αναφέρει η Δρ. Katharine Hall καθηγήτρια της Ιατρικής Σχολής Dunedin, σε άρθρο που δημοσιεύτηκε στο The Ancient History Bulletin, ο θάνατος του μεγάλου στρατηλάτη φαίνεται ότι προήλθε εξαιτίας μιας νευρολογικής διαταραχής, του συνδρόμου Guillain- Barre, ενός αυτοάνοσου νοσήματος (GBS).
Η Δρ. Hall υποστηρίζει ότι ο Μέγας Αλέξανδρος μπορεί να υπέφερε από μια νευρολογική διαταραχή που είναι γνωστή ως σύνδρομο Guillain-Barré. Εξηγεί ακόμη ότι οι παριστάμενοι μπορεί να μην είχαν παρατηρήσει σημάδια αποσύνθεσης στο σώμα του για τον απλό λόγο ότι ο 32χρονος βασιλιάς δεν ήταν ακόμη νεκρός, παρότι οι γιατροί του πίστεψαν ότι είχε πεθάνει.
Σύμφωνα με τη Δρ. Hall οι προηγούμενες θεωρίες δεν έχουν εξηγήσει γιατί το σώμα του δεν έδειξε σημάδια αποσύνθεσης για έξι ολόκληρες ημέρες. Ο Μακεδόνας βασιλιάς λέγεται πως παρουσίασε πυρετό, πόνο στην κοιλιά, προοδευτική και συμμετρική παράλυση. Σύμφωνα με την ιστορικό και καθηγήτρια μια διάγνωση με GBS, το οποίο μπορεί να προέκυψε εξαιτίας μόλυνσης με καμπυλοβακτήριο (Campylobacter pylori) του πυλωρού παρέχει μια ικανοποιητική εξήγηση. Σύμφωνα με τη θεωρία της, ο Αλέξανδρος κόλλησε μια παραλλαγή του GBS, που προκαλούσε παράλυση και, σε συνδυασμό με το γεγονός ότι στην αρχαιότητα οι γιατροί βασίζονταν στην παρουσία, ή την απουσία της αναπνοής, αντί για τον σφυγμό, για να καθορίσουν αν ένας ασθενής ήταν ζωντανός ή νεκρός, η Δρ. Hall πιστεύει ότι ο Μέγας Αλέξανδρος μπορεί να θεωρήθηκε νεκρός πριν πεθάνει.
Ο θάνατός του μπορεί να είναι η πιο διάσημη περίπτωση νεκροφάνειας, ή λανθασμένης διάγνωσης θανάτου, που έχει καταγραφεί ποτέ στην Ιστορία, λένε τώρα οι ερευνητές και ζητούν να αναθεωρηθεί η ιστορία.